Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ58

Larp1, La-related protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1Q6ZQ58 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Larp1Q6ZQ58 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms