Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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Chsy1Q6ZQ11 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chsy1Q6ZQ11 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms