Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm3bQ6ZPY7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm3bQ6ZPY7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm3bQ6ZPY7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm3bQ6ZPY7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm3bQ6ZPY7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm3bQ6ZPY7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm3bQ6ZPY7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm3bQ6ZPY7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm3bQ6ZPY7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm3bQ6ZPY7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm3bQ6ZPY7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm3bQ6ZPY7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm3bQ6ZPY7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm3bQ6ZPY7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm3bQ6ZPY7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm3bQ6ZPY7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm3bQ6ZPY7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm3bQ6ZPY7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms