Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ino80Q6ZPV2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ino80Q6ZPV2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms