Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Glis3Q6XP49 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms