Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rhox8Q6VSS7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms