Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Slc9c1Q6UJY2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc9c1Q6UJY2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms