Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf316Q6PGE4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf316Q6PGE4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms