Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc85bQ6PDY0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms