Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd4Q6PDQ2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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