Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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