Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhb9Q6PB60 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms