Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAI4

Lce3f, Late cornified envelope 3F, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3fQ6PAI4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms