Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl2Q6PA06 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms