Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slf2Q6P9P0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slf2Q6P9P0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms