Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx6Q6P8X1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx6Q6P8X1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms