Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC061212Q6P8K3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC061212Q6P8K3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms