Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Slx4Q6P1D7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms