Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf9bQ6NZA9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms