Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mvb12bQ6KAU4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mvb12bQ6KAU4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms