Protein–RNA interactions for Protein: Q6J1H4

Utf1, Undifferentiated embryonic cell transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utf1Q6J1H4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Utf1Q6J1H4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms