Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ParpbpQ6IRT3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms