Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud6aQ6IE21 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms