Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scaf8Q6DID3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms