Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Smarca2Q6DIC0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Smarca2Q6DIC0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms