Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp7Q6A4J8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp7Q6A4J8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp7Q6A4J8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp7Q6A4J8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp7Q6A4J8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp7Q6A4J8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp7Q6A4J8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp7Q6A4J8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp7Q6A4J8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp7Q6A4J8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp7Q6A4J8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp7Q6A4J8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp7Q6A4J8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp7Q6A4J8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp7Q6A4J8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp7Q6A4J8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp7Q6A4J8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp7Q6A4J8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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