Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Cep290Q6A078 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Cep290Q6A078 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Cep290Q6A078 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Cep290Q6A078 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Cep290Q6A078 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Cep290Q6A078 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Cep290Q6A078 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep290Q6A078 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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