Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z37

Samd9l, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd9lQ69Z37 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Samd9lQ69Z37 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Samd9lQ69Z37 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms