Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms