Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Nlrp4eQ66X19 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrp4eQ66X19 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms