Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms