Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ino80dQ66JY2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ino80dQ66JY2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms