Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnna3Q65CL1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctnna3Q65CL1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms