Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprdQ64487 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms