Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf4Q64310 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Surf4Q64310 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms