Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt12Q64291 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt12Q64291 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms