Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ScxQ64124 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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ScxQ64124 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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ScxQ64124 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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ScxQ64124 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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ScxQ64124 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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ScxQ64124 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ScxQ64124 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ScxQ64124 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms