Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pan3Q640Q5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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