Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PatjQ63ZW7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PatjQ63ZW7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PatjQ63ZW7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PatjQ63ZW7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PatjQ63ZW7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PatjQ63ZW7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PatjQ63ZW7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PatjQ63ZW7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PatjQ63ZW7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms