Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic2Q62520 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms