Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CochQ62507 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CochQ62507 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CochQ62507 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CochQ62507 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CochQ62507 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CochQ62507 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CochQ62507 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CochQ62507 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CochQ62507 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CochQ62507 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CochQ62507 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CochQ62507 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CochQ62507 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CochQ62507 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CochQ62507 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CochQ62507 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CochQ62507 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CochQ62507 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CochQ62507 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CochQ62507 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CochQ62507 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CochQ62507 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CochQ62507 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CochQ62507 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CochQ62507 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CochQ62507 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CochQ62507 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CochQ62507 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CochQ62507 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CochQ62507 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CochQ62507 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CochQ62507 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CochQ62507 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CochQ62507 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CochQ62507 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CochQ62507 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CochQ62507 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CochQ62507 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CochQ62507 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CochQ62507 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CochQ62507 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CochQ62507 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CochQ62507 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CochQ62507 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CochQ62507 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CochQ62507 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CochQ62507 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CochQ62507 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CochQ62507 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CochQ62507 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CochQ62507 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CochQ62507 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CochQ62507 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CochQ62507 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CochQ62507 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CochQ62507 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CochQ62507 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CochQ62507 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CochQ62507 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CochQ62507 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CochQ62507 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CochQ62507 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms