Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vil1Q62468 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vil1Q62468 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vil1Q62468 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vil1Q62468 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Vil1Q62468 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vil1Q62468 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vil1Q62468 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vil1Q62468 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vil1Q62468 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vil1Q62468 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms