Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vamp1Q62442 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vamp1Q62442 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vamp1Q62442 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vamp1Q62442 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vamp1Q62442 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vamp1Q62442 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vamp1Q62442 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Vamp1Q62442 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Vamp1Q62442 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Vamp1Q62442 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vamp1Q62442 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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