Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Epha6Q62413 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms