Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff3Q62395 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff3Q62395 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff3Q62395 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff3Q62395 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff3Q62395 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff3Q62395 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff3Q62395 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff3Q62395 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff3Q62395 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff3Q62395 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff3Q62395 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff3Q62395 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff3Q62395 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff3Q62395 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff3Q62395 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff3Q62395 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff3Q62395 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff3Q62395 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff3Q62395 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff3Q62395 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff3Q62395 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tff3Q62395 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tff3Q62395 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff3Q62395 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff3Q62395 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tff3Q62395 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tff3Q62395 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff3Q62395 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff3Q62395 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff3Q62395 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tff3Q62395 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff3Q62395 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tff3Q62395 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms