Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt6hQ62383 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Supt6hQ62383 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt6hQ62383 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms