Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ss18Q62280 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ss18Q62280 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ss18Q62280 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ss18Q62280 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Ss18Q62280 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ss18Q62280 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ss18Q62280 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ss18Q62280 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ss18Q62280 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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