Protein–RNA interactions for Protein: Q62193

Rpa2, Replication protein A 32 kDa subunit, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa2Q62193 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpa2Q62193 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rpa2Q62193 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rpa2Q62193 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpa2Q62193 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms