Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema3bQ62177 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3bQ62177 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms