Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms